آیتالله خامنهای بعد پایان دور اول ریاست جمهوریشان، در دورهی چهارم انتخابات ریاست جمهوری هم نامزد انتخابات شدند و توانستند با کسب بیش از 85 درصد آراء به سمت ریاست جمهوری ایران انتخاب شوند. تنفیذ این دوره از انتخابات نیز در تاریخ 13 شهریور 1364 در حسینیه جماران برگزار شد.