گزارش تحقیق و تفحص از دانشگاه آزاد در چند نوبت در کمیسیون آموزش مجلس بررسی شده و قرار است به‌زودی در صحن علنی مجلس قرائت شود؛ اما دلایل مشخصی، از جمله همکاری نکردن هیئت‌امنای این دانشگاه در تحقیق و بازرسی از ساختمان این هیئت، موجب شده این گزارش کامل نشود. در همین زمینه برخی از اعضای این کمیته به دلیل ممانعت هیئت امنای دانشگاه آزاد از تحقیق درباره عملکردشان، عملاً فعالیت خود را در این کمیته به حالت تعلیق درآورده‌اند.

خرداد ماه سال ۸۹، دادسرای تهران با انتشار بیانیه‌ای از کشف اسناد مهمی از جمله «اسناد زیادی درباره برخي قراردادهاي نفت و گاز»، «اسناد مالي غيرمرتبط با دانشگاه آزاد»، «اسناد محرمانه دولتي» از ساختمان هیئت‌امنای دانشگاه آزاد متعلق به مهدی هاشمی رفسنجانی خبر داده بود.