علی مطهری درباره انتشار دایره‌المعارف نٌه‌جلدی فتنه88 گفت: من این مجموعه را ندیده‌ام، ولی به‌طور کلی این طور کتاب‌ها اعتباری ندارند زیرا در یک نزاع سیاسی تا زمانی که حرف طرف مقابل و دفاعیاتش را نشنویم، نمی‌توانیم قضاوت منصفانه‌ای داشته باشیم. هر وقت حرف دو طرف وجود داشت، آن زمان می‌توان گفت که مسائل مطابق واقعیت است. انتشار این کتاب صرفاً بر اساس ادعاهای ثابت نشده است. ظاهراً عکس موسوی، کروبی و خاتمی هم روی جلد این کتاب‌ها چاپ شده. حتی اگر خود این‌ها شکایتی نکنند، قوه قضائیه و مدعی‌العموم می‌تواند وارد شود. البته آن‌ها شکایت نخواهند کرد؛ زیرا می‌دانند شکایتشان بررسی نمی‌شود..!

تحلیل‌:معلوم نیست آقای علی‌ مطهری خودفریبی می‌کند یا دیگر فریبی؟ آیا ده‌ها بیانیه، پیام، نامه و... که موسوی و کروبی و... در ایام فتنه منتشر کردند، حرف‌های آن‌ها نبود؟ ظاهراً این حرف‌های مکتوب آنچنان زیاد است که گفته شده یکی از مجلدات کتاب مذکور به همین امر اختصاص داده شده است. آیا وجود اینهمه سند قطعی برای قضاوت درباره رفتار آن‌ها کفایت نمی‌کند؟! در نبود انصاف و گریز از حقیقت، مفهوم واژگان نیز تغییر می‌کند و تا مرز تحریف پیش‌ می‌رود!